科学家报告的新型肝炎病毒是一种误报

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  科学家报告的新型肝炎病毒是一种误报

  2013年9月27日

  根据加州大学旧金山分校的研究人员的说法,科学家们今年早些时候报道了一种新型肝炎病毒的报告是误报,他们正确地将病毒鉴定为许多研究实验室中使用的一种玻璃器皿中的污染物。他们说,他们的发现突出了今天强大的下一代实验室技术的前景和危险,这些技术用于追踪新的疾病。

  在2013年9月11日在线发表的研究中,在病毒学杂志上,由加州大学旧金山分校病毒诊断和发现中心主任Charles Chiu博士领导的研究人员将污染源追溯到微小的硅藻,这是一种海洋藻类与人类疾病无关。

  

  由美国国立卫生研究院(NIH)的研究人员领导的一个科学小组首次将这种病毒鉴定为一种潜在的肝炎病因,这项病毒来自中国92名患有血液样本的人,他们患有严重的肝炎病例而不是由已知的五种病毒引起的。肝炎病毒。 Chiu及其同事在一组不同的肝炎患者中发现了同样的病毒,他们称之为细小病毒样杂交病毒(PHV),这些病人的疾病不是由已知病毒引起的。

  为了进一步研究病毒的起源,Chiu-s UCSF团队通过在一系列精心控制的实验中应用下一代DNA测序技术,并参考不断扩展的科学数据库,详细说明和编目病毒,追踪其真正来源基因组。

   - 首先我们认为这是一种真正的肝炎病毒,但后来我们在患有许多其他疾病甚至动物的患者的数据集中发现了它, - 加州大学旧金山分校实验医学教授Chiu说。

  研究人员还发现,从世界各地的样本中测序的病毒奇怪地表现出几乎没有基因组多样性。研究小组强烈怀疑PHV是一种实验室污染物,并开始探测其他数据库以寻找病毒的真正来源。

   - 我们对环境数据库进行了一些数据挖掘,发现来自加利福尼亚州和俄勒冈州沿海水域的病毒的匹配DNA序列,但在其他地方没有--Chiu说。

  Chiu说,采样和测试技术的开发者可能从海洋中的硅藻中采购了二氧化硅,制成了一种用于研究的流行玻璃柱。这些色谱柱用于离心旋转生物样品以提取核酸 - DNA和RNA。他说,可能曾经感染过硅藻的病毒DNA也可能在手术过程中被提取为污染物,同时还有来自生物样本的DNA。

   - 几乎所有商业旋转柱中使用的二氧化硅都来自硅藻的细胞壁,他说。 - 我们认为PHV可能是一种硅藻病毒,在制造过程中无意中污染了二氧化硅基旋转柱.-科学家们不知道在研究中是什么原因引起了肝炎病例。

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  早期开发的技术用于读出从生物样品中提取的DNA构建块的序列,这允许逐步解码基因并最终表征人和其他生物的整个基因组。

  但近年来,改变游戏规则的技术进步被称为新一代测序技术,通过实验室协议,可以在一次运行中对数百万个DNA分子进行指数级更快,更便宜的测序。

  Chiu说,这些最先进的技术可以将来自微量DNA的生物基因组拼接在一起,可以有效地检测以前科学不为人知的病原体,但它们也非常敏感,很容易吸收污染物。

  Chiu说,目前尚不清楚为什么NIH领导的团队也没有检测到对照样品中的污染DNA。 Chiu推测,与肝炎患者的样本相比,对照样本的分析可能使用了不同的技术,或者玻璃器皿可能存在批次差异。

  近年来,一种名为XMRV的小鼠病毒在2006年首次报道了类似的病毒性假警报情景。该病毒最初被认为与人类前列腺癌和慢性疲劳综合症有关,但去年Chiu和其他人,包括原始XMRV共同发现者Joseph DeRisi,博士,霍华德休斯医学研究所研究员和加州大学旧金山分校生物化学教授证实,XMRV实际上是实验室细胞培养的病毒污染物,并且不存在于前列腺癌组织中。

  Chiu说,这些研究强调了重复实验的重要性,以确保结果准确。 - 可再生性是科学的基石,但是通过后续调查验证的研究太少 - 他说。他补充说,下一代测序是一种很有前途的方法,可以快速确认和验证新疾病病原体的发现,从而节省时间和金钱上的投资,否则可能会用于追求虚假线索。

  资料来源:加州大学旧金山分校